IDENTIFICATION OF GENOMIC REGIONS ASSOCIATED WITH PLANT ARCHITECTURAL TRAITS IN LENTIL (Lens culinaris Medik)
Loading...
Date
2019-07
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
CSKHPKV, Palampur
Abstract
Lenttiill ((Lens culliinariis Mediik subsp.. culliinariis)) iis an auttogamous diiplloiid ((2n=2x=14)),,
cooll season ffood llegume crrop cullttiivatted glloballlly.. Genomiic rresourrces iin llenttiill arre lliimiitted iin
comparriison tto ottherr ffood llegumes,, prriimarriilly due tto llarrge genome siize and llack off genettiic
varriiattiion.. Furrttherr,, llenttiill prroducttiion iis hamperred due tto grrowiing underr shorrtterr day llengtth and
narrrrow genettiic bases off rrelleased cullttiivarrs rresponsiiblle fforr yiielld llosses iin llenttiill.. Pllantt heiightt,,
numberr off brranches,, lleaff arrea,, rrespecttiive posiittiion off tthe orrgans ((lleaff,, sttem,, ffllowerrs and
ffrruiitts)),, arre genettiicalllly conttrrolllled,, butt allso depend on enviirronmenttall iinfflluences orr human
iintterrventtiions.. The prresentt iinvesttiigattiions aiimed tto consttrructt iinttrraspeciiffiic llenttiill lliinked map
usiing 91 RIILs popullattiion tto iidenttiiffy rregiion lliinked tto pllantt arrchiittectturrall ttrraiitts.. Siix hundrred
fforrtty tthrree SSR marrkerrs ((iinclludiing prreviiouslly publliished anchorr marrkerrs)) werre scrreened fforr
parrenttall pollymorrphiism and 343 ((27..90 %)) werre ffound tto be pollymorrphiic among tthe parrentts..
334 pollymorrphiic marrkerrs,, werre mapped on seven lliinkage grroups att LOD 4..0 spanniing 987..0
cM wiitth an averrage marrkerr densiitty off 2..95 cM.. The rresulltts rrevealled 80 new SSRs assiigniined
on tthe lliinkage map..
Anallysiis off varriiance rrevealled siigniiffiicantt diifffferrences fforr allll tthe 8 measurred
arrchiittectturrall ttrraiitts bettween „„L830‟‟ and „„Prrecoz‟‟.. The ANOVA off 91 RIILs rrevealled
siigniiffiicantt diifffferrences fforr allmostt allll tthe ttrraiitts.. Phenottypiic datta ffrrom tthe RIILs werre used tto
iidenttiiffy QTLs fforr pllantt arrchiittectturrall ttrraiitts by composiitte iintterrvall mappiing ((CIIM)).. A ttottall off
29 QTLs ((LOD ≥ 3..0)) werre dettectted on seven lliinkage grroups.. Phenottypiic varriiattiion expllaiined
((PVE)) by QTLs rranged ffrrom 11..9 tto 41..9 perr centt.. The hiighestt phenottypiic varriiattiion ((41..9 %))
was expllaiined by tthe QTLs fforr 100--seed weiightt..
IIn concllusiion,, iitt iis enviisaged tthatt tthe prresentt lliinkage map,, fforrttiiffiied wiitth 334 SSR
marrkerrs and 29 QTLs fforr pllantt arrchiittectturrall ttrraiitts woulld prroviide genomiics ttoolls fforr ffurrttherr
genettiic enhancementt off tthiis crrop speciies.. Thus,, tthe currrrentt sttudy woulld serrve as a sttrrong
ffoundattiion fforr ffurrttherr valliidattiion and ffiine mappiing off QTLs fforr uttiilliizattiion iin llenttiill brreediing
prrogrrams.
Description
Keywords
null